Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRFP10586 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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