Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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