Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP133-201ENST00000364845 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC003080.1-201ENST00000413552 767 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC010320.1-201ENST00000599775 578 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PROX1-AS1-208ENST00000601335 691 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC010385.2-201ENST00000603743 490 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC010533.1-201ENST00000624875 2105 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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TIMMDC1Q9NPL8 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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TIMMDC1Q9NPL8 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SHC4-203ENST00000537958 1447 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OAS2-207ENST00000620097 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PAGE5-203ENST00000374955 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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