Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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