Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC234917.1-201ENST00000534006 316 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC015674.1-201ENST00000578482 267 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms