Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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CNGB1Q14028 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
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