Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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ITGB3BPQ13352 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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ITGB3BPQ13352 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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ITGB3BPQ13352 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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ITGB3BPQ13352 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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ITGB3BPQ13352 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ITGB3BPQ13352 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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