Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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IFT88Q13099 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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