Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 USP32P1-201ENST00000341745 3233 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC098583.2-201ENST00000504151 372 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNF185-AS1-201ENST00000526089 353 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC073913.2-201ENST00000541512 145 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MCTP1-201ENST00000312216 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC092279.2-201ENST00000623742 2189 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MKL2-207ENST00000573051 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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MKRN3Q13064 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CYP4A11-203ENST00000371905 1725 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TRHR-202ENST00000518632 1660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 STEAP3-AS1-201ENST00000454260 3218 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01139-201ENST00000400946 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SEPT4-211ENST00000579371 1362 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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MKRN3Q13064 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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MKRN3Q13064 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MED28P1-201ENST00000399158 571 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TIMM8AP1-201ENST00000419283 295 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ERVMER34-1-202ENST00000443173 3830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AF186996.2-201ENST00000508347 907 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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