Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTP4A2Q12974 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTP4A2Q12974 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTP4A2Q12974 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PTP4A2Q12974 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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