Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms