Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms