Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC02330-201ENST00000557784 555 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC106875.2-201ENST00000617634 596 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC100771.2-201ENST00000525833 1350 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC136604.3-202ENST00000514793 485 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OAS2-207ENST00000620097 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 FPR3-202ENST00000595991 2222 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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