Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CNTN3Q9P232 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CNTN3Q9P232 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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