Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MIS18AQ9NYP9 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms