Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GDAP2Q9NXN4 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GDAP2Q9NXN4 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms