Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC1P3-201ENST00000453822 1318 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms