Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIP13Q15645 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms