Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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CHD4Q14839 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CHD4Q14839 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CHD4Q14839 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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