Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
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TCOF1Q13428 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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TCOF1Q13428 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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