Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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