Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC33■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms