Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms