Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
WASHC2CQ9Y4E1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms