Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRRAPQ9Y4A5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRRAPQ9Y4A5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms