Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms