Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms