Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POMPQ9Y244 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms