Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNEQ9Y223 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms