Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-11Q9UQG0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-11Q9UQG0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms