Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms