Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518 ms