Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms