Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms