Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND2AQ9ULE3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms