Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKLN1Q9UL63 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms