Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms