Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms