Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBE1Q9UJT0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms