Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SALL4Q9UJQ4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SALL4Q9UJQ4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SALL4Q9UJQ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SALL4Q9UJQ4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL4Q9UJQ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms