Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms