Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms