Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms