Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms