Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms