Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms