Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
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