Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHRF1Q9P1Y6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms