Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CABP1Q9NZU7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms