Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGEF12Q9NZN5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGEF12Q9NZN5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGEF12Q9NZN5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGEF12Q9NZN5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms